Wzmocnienie roślin przed chorobami uzyskuje się przede wszystkim wprowadzając transgen kodujący między innymi hitynazę i glikonazę. Są to białka enzymatyczne, które rozkładają ściany komórkowe bakterii i grzybów atakujących rośliny. Inną możliwością jest dodanie genu osmotyny. W tym przypadku jest to białko, które po związaniu się z błoną komórkową patogenów powoduje jej dezorganizację .
Odporność na wirusy zyskują rośliny, w genomie których umieszczone zostały geny kodujące białka wirusowych kapsydów lub ich enzymów - replikaz i proteaz. Tego typu zabiegi są swoistą szczepionką dla roślin. Po jej aplikacji ewentualna infekcja u rośliny zdolnej do rozpoznania białek określonego wirusa jest znacznie słabsza, a skutki choroby pojawiają się ze znacznym opóźnieniem.